Ich hatte bei meinem neuen PC genau die gleichen Probleme mit dem eLicenser.
Beim Starten von Cubase haben manche Plugins sogar geladen, andere danach die Lizenz angemeckert → Stick raus, wieder rein, weiter gings… das ganze hatte ich dann ständig.
Ein neuer eLicenser hat bei mir damals nicht geholfen…
Letztendlich hat sich herausgestellt, dass es Probleme mit einem bestimmten USB 3.0 Chipsatz gibt.
Mein Board hatte aber sowohl USB 3.0 als auch USB 2.0 Anschlüsse.
Seit ich den USB Dongle an den USB 2.0 Ports betreibe, gibt es bei mir keine Probleme mehr.
Falls das bei Dir nichts hilft, auf jeden Fall den Support analyiseren lassen - hat mir damals sehr geholfen.
Gruß
Chris