Wenn Dein Rechner “fit” ist, sehe ich eigentlich keinen Grund, dort nicht auch in 64Bit zu fahren…
Aber das hat mit Deinem Problem nichts zu tun.
Ich würde die Boxversion und alle kopierten dll’s runterschmeißen und über die Waves Central eine neue und aktuelle Installation machen. Wichtig ist doch nur die Lizenz auf dem USB-Stick.
Waves installiert zwar die Vst2-Waveshells nach ProgramFiles/ VstPlugins, aber die Vst3-Waveshell liegt in ProgramFiles/ CommonFiles/ Vst3. Und nur die ist für Cubase interessant und wird genutzt. Ich lösche daher auch nach jeder Aktualisierung den unnötigen ProgramFiles/ VstPlugins-Ordner.
Und nicht vergessen, nach der Neuinstallation die Vst2Plugins Cubase.xml in C:\Users\DeinName\AppData\Roaming\Steinberg\Cubase 8.5_64 zu löschen, damit Cubase die neu anlegt.